如果选择做的是羊水穿刺、绒毛穿刺亲子鉴定，有一定的风险性，容易出现感染，导致胎儿健康受到威胁。约有2～3%的孕妈咪在羊水穿刺后会出现轻微的子宫收缩及阴道流血，约有0.5%的孕妈咪会出现羊膜炎、胎膜破裂及流产。如果医生操作不当，还有可能造成胎儿畸形，因此一定要慎重考虑。
如果选择的是无创胎儿亲子鉴定，不会伤害到孩子。因为无创胎儿亲子鉴定是非常简单的操作，只需要在孕5周后抽取孕妇手臂上10ml的血，没有直接跟胎儿接触，对胎儿完全没影响，更别说有什么危险了。无创胎儿亲子鉴定至今已经有20多年的历史了，无论是诊断的准确性还是安全性，都得到医学界的公认。孕妈咪只要建议注意休息，加强营养，按时产前检查，一定能生个健康、可爱的娃娃。
无创产前胎儿鉴定需要抽取孕妇手臂10ml的静脉血母体静脉血做亲子鉴定，以及怀疑父亲对象的常规样本(如：血液、毛发、指甲、口腔拭子等);抽取静脉血需要到鉴定中心的专业护士进行采集。与传统的产前胎儿鉴定相比，之前的样本采集方式是去正规医院抽取羊水或者绒毛(两者对孕周的要求都相对比较严格，而且可鉴定的孕期是比无创的要长)。因此无创产前鉴定操作简单，更为安全，对孕妇和胎儿都没有什么影响。
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